Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC27P30260 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC27P30260 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC27P30260 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC27P30260 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC27P30260 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC27P30260 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC27P30260 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC27P30260 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC27P30260 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC27P30260 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC27P30260 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC27P30260 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC27P30260 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC27P30260 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC27P30260 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC27P30260 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC27P30260 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC27P30260 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC27P30260 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC27P30260 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC27P30260 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC27P30260 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC27P30260 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC27P30260 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms