Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBMS1P29558 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBMS1P29558 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms