Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5AP29375 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms