Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1CP29017 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1CP29017 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1CP29017 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1CP29017 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD1CP29017 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1CP29017 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1CP29017 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD1CP29017 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD1CP29017 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1CP29017 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1CP29017 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms