Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR2AP28223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms