Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms