Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTFRP26992 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTFRP26992 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms