Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DNMT1P26358 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms