Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND1P24385 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND1P24385 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND1P24385 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND1P24385 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND1P24385 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND1P24385 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCND1P24385 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCND1P24385 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND1P24385 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms