Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP11P24347 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP11P24347 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP11P24347 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP11P24347 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MMP11P24347 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP11P24347 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP11P24347 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP11P24347 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP11P24347 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP11P24347 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP11P24347 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP11P24347 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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