Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRBP23467 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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