Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMPD1P23109 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AMPD1P23109 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms