Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRC1P22897 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRC1P22897 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRC1P22897 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MRC1P22897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRC1P22897 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRC1P22897 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRC1P22897 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRC1P22897 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRC1P22897 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MRC1P22897 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRC1P22897 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRC1P22897 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRC1P22897 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRC1P22897 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRC1P22897 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRC1P22897 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRC1P22897 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MRC1P22897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRC1P22897 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRC1P22897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRC1P22897 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MRC1P22897 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRC1P22897 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRC1P22897 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRC1P22897 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRC1P22897 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRC1P22897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRC1P22897 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRC1P22897 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRC1P22897 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MRC1P22897 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MRC1P22897 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MRC1P22897 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms