Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP4AP20648 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms