Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B1P20020 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms