Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL3P19876 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL3P19876 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms