Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM21P19474 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms