Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCLP19338 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCLP19338 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCLP19338 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCLP19338 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCLP19338 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCLP19338 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCLP19338 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCLP19338 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCLP19338 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCLP19338 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCLP19338 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCLP19338 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCLP19338 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCLP19338 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCLP19338 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCLP19338 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCLP19338 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NCLP19338 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCLP19338 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCLP19338 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms