Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF1P18846 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF1P18846 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF1P18846 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF1P18846 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF1P18846 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF1P18846 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF1P18846 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF1P18846 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF1P18846 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF1P18846 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF1P18846 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF1P18846 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF1P18846 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms