Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCLP18206 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCLP18206 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCLP18206 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCLP18206 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCLP18206 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCLP18206 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCLP18206 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCLP18206 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCLP18206 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCLP18206 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCLP18206 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCLP18206 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCLP18206 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms