Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB5P18084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms