Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC2P18074 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC2P18074 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC2P18074 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC2P18074 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.5 ms