Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYN1P17600 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYN1P17600 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYN1P17600 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYN1P17600 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYN1P17600 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYN1P17600 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYN1P17600 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYN1P17600 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYN1P17600 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYN1P17600 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYN1P17600 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYN1P17600 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYN1P17600 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYN1P17600 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYN1P17600 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYN1P17600 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYN1P17600 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYN1P17600 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYN1P17600 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYN1P17600 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYN1P17600 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYN1P17600 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYN1P17600 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYN1P17600 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYN1P17600 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYN1P17600 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYN1P17600 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYN1P17600 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms