Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA1P17302 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA1P17302 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA1P17302 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA1P17302 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA1P17302 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA1P17302 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA1P17302 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA1P17302 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA1P17302 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA1P17302 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA1P17302 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA1P17302 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA1P17302 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GJA1P17302 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJA1P17302 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms