Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A2P16615 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2A2P16615 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms