Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB4P16144 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms