Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATA1P15976 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATA1P15976 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATA1P15976 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATA1P15976 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATA1P15976 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATA1P15976 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATA1P15976 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms