Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms