Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms