Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA3P15088 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA3P15088 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA3P15088 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA3P15088 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA3P15088 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA3P15088 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA3P15088 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA3P15088 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA3P15088 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA3P15088 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA3P15088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA3P15088 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA3P15088 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA3P15088 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA3P15088 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms