Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCP1P13796 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCP1P13796 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCP1P13796 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCP1P13796 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCP1P13796 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCP1P13796 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCP1P13796 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LCP1P13796 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCP1P13796 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCP1P13796 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCP1P13796 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCP1P13796 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCP1P13796 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCP1P13796 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LCP1P13796 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCP1P13796 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms