Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CETPP11597 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CETPP11597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CETPP11597 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CETPP11597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CETPP11597 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CETPP11597 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CETPP11597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CETPP11597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CETPP11597 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CETPP11597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CETPP11597 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CETPP11597 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CETPP11597 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CETPP11597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CETPP11597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CETPP11597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CETPP11597 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CETPP11597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CETPP11597 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CETPP11597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CETPP11597 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CETPP11597 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms