Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALAP11233 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALAP11233 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALAP11233 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALAP11233 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALAP11233 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALAP11233 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALAP11233 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALAP11233 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALAP11233 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALAP11233 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALAP11233 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALAP11233 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALAP11233 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALAP11233 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RALAP11233 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALAP11233 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RALAP11233 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RALAP11233 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALAP11233 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALAP11233 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALAP11233 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALAP11233 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALAP11233 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALAP11233 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALAP11233 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms