Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HKR1P10072 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HKR1P10072 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HKR1P10072 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HKR1P10072 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HKR1P10072 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HKR1P10072 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HKR1P10072 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HKR1P10072 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HKR1P10072 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HKR1P10072 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms