Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMD1P0DJR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms