Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms