Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC159P0C7I6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC159P0C7I6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC159P0C7I6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC159P0C7I6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC159P0C7I6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC159P0C7I6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms