Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4BP0C0L5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C4BP0C0L5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C4BP0C0L5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4BP0C0L5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms