Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP1P09874 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP1P09874 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP1P09874 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP1P09874 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP1P09874 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP1P09874 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP1P09874 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP1P09874 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP1P09874 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP1P09874 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP1P09874 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP1P09874 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP1P09874 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP1P09874 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP1P09874 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP1P09874 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP1P09874 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP1P09874 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP1P09874 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP1P09874 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP1P09874 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP1P09874 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP1P09874 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP1P09874 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP1P09874 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms