Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 535.3 ms