Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC4P09017 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC4P09017 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms