Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOP08100 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOP08100 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOP08100 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOP08100 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOP08100 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOP08100 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOP08100 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOP08100 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOP08100 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOP08100 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOP08100 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOP08100 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms