Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2AP05549 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2AP05549 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms