Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGF1P05230 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGF1P05230 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGF1P05230 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGF1P05230 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGF1P05230 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGF1P05230 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGF1P05230 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGF1P05230 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGF1P05230 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGF1P05230 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGF1P05230 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGF1P05230 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGF1P05230 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGF1P05230 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGF1P05230 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGF1P05230 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGF1P05230 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGF1P05230 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGF1P05230 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms