Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPN2P04844 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPN2P04844 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPN2P04844 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPN2P04844 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPN2P04844 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPN2P04844 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPN2P04844 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN2P04844 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN2P04844 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN2P04844 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPN2P04844 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN2P04844 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN2P04844 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN2P04844 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN2P04844 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN2P04844 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN2P04844 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms