Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMG1P04279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMG1P04279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMG1P04279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms