Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT1P04264 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT1P04264 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT1P04264 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT1P04264 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT1P04264 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT1P04264 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT1P04264 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT1P04264 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT1P04264 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT1P04264 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT1P04264 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT1P04264 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT1P04264 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT1P04264 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT1P04264 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT1P04264 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT1P04264 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT1P04264 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms