Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms