Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFP01375 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFP01375 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFP01375 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFP01375 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFP01375 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFP01375 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFP01375 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFP01375 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFP01375 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFP01375 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFP01375 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFP01375 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFP01375 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFP01375 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms