Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIMP1P01033 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP1P01033 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms